O diagnóstico das lipodistrofias é clínico, contudo, testes genéticos podem ser realizados em casos de suspeita de herança familiar. A ocorrência dos sinais e/ou sintomas  abaixo, associado com a alteração de distribuição de gordura corporal, pode indicar a presença de lipodistrofia:

• Diabetes de difícil manejo
• Uso de altas doses de insulina (>2 UI/Kg/dia)
• Triglicerídeos séricos persistentemente elevados
• Hepatomegalia ou doença hepática gordurosa não alcoólica
• Síndrome dos ovários policísticos
• Infertilidade
• Oligomenorreia (diminuição da quantidade de menstruação ou longos períodos sem menstruar).
• Hirsutismo (excesso de pelo)
• Pancreatite
• Doença renal

A realização de um exame físico minucioso é de fundamental para a suspeição da doença, conforme é demonstrado nas imagens abaixo: